Shedko S.V., Miroshnichenko I.L., Nemkova G.A., Koshelev V.N., Shedko M.B.
В журнале Russian Journal of Genetics
Год: 2015 Том: 51 Номер: 2 Страницы: 169-184
Исследована изменчивость контролирующего участка (D-петли) мтДНК у амурского осетра – эндемика р. Амур, находящегося в Красном списке МСОП (IUCN) в статусе вида с крайне высоким риском вымирания в природе (Critically Endangered). Секвенирование 796–812 пн D-петли у 112 осетров, собранных в Нижнем Амуре, выявило 73 различных гаплотипа. Выборка имела высокий уровень гаплотипического (0.976) и нуклеотидного (0.0194) разнообразия. Найденные гаплотипы распались на две хорошо выраженные монофилетические группировки – BG (n=39) и SM (n=34), различавшиеся (HKY-дистанция) в среднем по 3.41% нуклеотидных позиций при среднем внутригрупповом уровне отличий в 0.54% и 1.23%, соответственно. Гаплотипы SM-группы отличались, кроме того, наличием делеции размером 13–14 пн. Большинство образцов (66 из 112) несли BG-гаплотипы. Форма распределения попарных нуклеотидных различий, результаты тестов на нейтральность, на соответствие модели внезапной демографической экспансии или модели экспоненциального роста в совокупности указали на произошедший в прошлом существенный рост численности популяции амурского осетра, наиболее отчетливо проявившийся при рассмотрении данных по BG гаплогруппе. Построенные байесовские контурные диаграммы (скайлайны) показали, что этот рост начался около 16–18 тыс. лет назад. В настоящее время эффективная численность сильно сократившейся из-за перелова популяции амурского осетра может быть равна или даже меньше той, что была до начала указанного роста – во время последнего ледникового максимума. Наличие в митохондриальном генном пуле амурского осетра двух гаплогрупп, их неодинаковая эволюционная динамика и, судя по ограниченным данным, неравная представленность в российской и китайской частях бассейна р. Амур указывают на возможное существование в прошлом как минимум двух отдельных его популяций.
