Шедько С.В., Мирошниченко И.Л., Немкова Г.А.
В журнале Генетика
Год: 2013 Том: 49 Номер: 6 Страницы: 718–734
На основе данных по митохондриальной ДНК, взятых из Genbank, и оригинальных материалов проанализированы филогенетические взаимоотношения 41 вида лососевых рыб, а также некоторые аспекты их диверсификации во времени. Положение корня филогенетического дерева Salmonidae оказалось неустойчивым. Среди возможных вариантов наиболее обоснованным выглядит тот, в котором хариусовые объединены в одну кладу с сиговыми, а линия лососевых занимает базальное относительно нее положение. Роды подсемейства Salmoninae составили две хорошо выраженные клады: (Brachymystax, Hucho) и (Salmo, Parahucho, (Salvelinus, (Parasalmo, Oncorhynchus)). При этом роды Parasalmo и Oncorhynchus оказались взаимно монофилетическими. Обсуждены вопросы конгруэнтности филогенетических деревьев Salmonidae, построенных по разным типам маркеров. Согласно байесовскому датированию, предковые линии лососевых и сестринских к ним щукообразных разошлись около 106 млн. лет назад. Некоторое время спустя - вероятно 100-70 млн. лет назад - произошла специфическая для лососевых полногеномная дупликация. Разделение у лососевых рыб линий родового уровня происходило много позже - в интервале 42-20 млн. лет назад. Основная волна диверсификации лососевых на видовом уровне имела место в последние 12 млн. лет. Обсуждено возможное влияние геномной дупликации на характер диверсификации Salmonidae.
