Поиск эндофитных микроорганизмов стильбен-содержащих растений Дальнего Востока России, обладающих антимикробными свойствами против широко распространённых патогенов растений
Изучен состав эндофитов дальневосточных растений: горца Polygonum cuspidatum и нескольких видов винограда Vitis vinifera, Vitis amurensis, Vitis coignetiae. На основе бактериальных и грибных метагеномов сделан анализ распространения патогенов растений, а именно Plasmopara viticola, который вызывает милдью винограда, на территории юга Дальнего Востока России. Анализ данных с использованием метода DESeq2 выявил потенциальных микробных антагонистов P. viticola, что важно разработки средств биоконтроля милдью. Собран и аннотирован геном эндофитной бактерии Bacillus velezensis (AMR25), выделенной из V. amurensis, который состоит из 3.9 Мб и содержит гены, ответственные за синтез антимикробных веществ и фитогормонов, что объясняет ее антимикробные свойства против патогенов растений. Таким образом, найдены бактерии, обладающие полезными для сельского хозяйства свойствами.
Сравнение бактериального (а) и грибного (б) эндофитного состава в различных органах горца Polygonum cuspidatum на основе секвенирования нового поколения (NGS, 16s и ITS метагеном)
