Филогеография корейской полевой мыши Apodemus peninsulae (Rodentia: Muridae): обновленные данные
Apodemus peninsulae - эпидемиологически значимый вид, широко распространенный в Азии. Высокое генетической разнообразие вида распределено неравномерно между популяциями. Филогенетический и филогеографический анализы выявили три основные группы гаплотипов: «китайскую» (С), «корейскую» (К) и «российскую» (R). Подходы на основе коалесценции предполагают связь между их разделением с последним интенсивным поднятием Тибетского нагорья. События быстрой демографической экспансии в R ассоциированы с MIS 3 и 4, а K - с MIS 6; признаков быстрой экспансии в С не обнаружено. Период LGM не повлиял на динамику численности популяций. Заселение северо-востока проходило двумя волнами: сначала в Северный Китай и Корейский полуостров, а затем на большую часть Сибири, Дальний Восток России и в Японию; некоторые территории Сибири, Монголии и северного Китая были колонизированы дважды.
Рисунок 1. Эволюционные связи корейской полевой мыши A. peninsulae на основе митохондриального гена сyt b. Значения бутстрепа и апостериорные вероятности (NJ/ML/BI) приведены в виде меток узлов.
Рисунок 2. Хронограмма по данным последовательностей митохондриального гена сyt b.
Рисунок 3. Медианная сеть всех гаплотипов сyt b корейской полевой мыши (A), а также филогеографических групп (R, K).
Рисунок 4. Демографический анализ корейской полевой мыши: слева - распределение попарных генетических дистанций; справа - байесовские горизонтальные графики для разных групп гаплотипов.
Рисунок 5. Распределение нуклеотидного разнообразия (Pi, ось Y) вдоль позиций нуклеотидов гена cyt b (ось X) в различных географических популяциях A. peninsulae.
Рисунок 6. Возможные пути миграции A. peninsulae в соответствии с заселением юга Сибири через Дальний Восток (A), или независимо от Дальнего Востока (B). Штриховка обозначает территории филогрупп R и K.
