Длительное культивирование клеточных линий женьшеня P. ginseng приводит к снижению синтеза ценных вторичных метаболитов, используемых в традиционной медицине. Чтобы получить представление о клеточных механизмах, которые могут влиять на этот процесс, мы проанализировали вариации внутри кластера рДНК линий клеток женьшеня, имеющих разное происхождение и возраст.
В 18S рДНК накапливались мутации во время культивирования клеток, что хорошо коррелирует с увеличением числа хромосом и ядрышек. Топологии филогенетических древ и структура нуклеотидного разнообразия специфичны для культуры, а возрастающий полиморфизм ассоциируется с сайтами метилирования цитозина. Вторичные структуры некоторых участков 18S рРНК и их взаимодействие могут изменяться во время культивирования. Наблюдаемые изменения в кластерах рДНК связаны с сомаклональными вариациями, что приводит к изменениям в паттерне внутриклеточного синтеза во время культивирования клеток. Выявленные дивергентные рРНК могут обеспечивать дополнительную регуляцию экспрессии генов в клетках женьшеня за счет образования гетерогенных рибосом.
