Внутригеномный полиморфизм и псевдогенизация гена OCA2 у дальневосточных сов (сем. Strigidae, Aves)

Спиридонова Л.Н., Сурмач С.Г.

В журнале Генетика

Год: 2025 Том: 61 Номер: 8 Страницы: 48-61

На примере семи дальневосточных видов сов: филина Bubo bubo, рыбного филина Bubo (Ketupa) blakistoni, полярной совы Bubo (Nyctea) scandiacus, ушастой совы Asio otus, длиннохвостой неясыти Strix uralensis, восточной совки Otus sunia и японской совки Otus semitorques впервые исследован внутригеномный полиморфизм фрагмента гена OCA2 (около 4800 пн), кодирующего трансмем- бранный P-белок, связанный с окраской оперения птиц. Внутригеномная изменчивость OCA2 в этой разнородной группе совообразных изменялась от 0.005 у B. bubo до 0.014 у O. sunia, что пре- вышает межвидовые значения по данному гену в родах Falco и Cygnus (0.000–0.006). Генетические дистанции между родами в сем. Strigidae широко варьировали (0.022–0.048), однако примерно соответствовали уровню таковых в сем. Accipitridae (0.015–0.040). Впервые у некоторых исследо- ванных видов обнаружены факты псевдогенизации гена OCA2, полученные на основании срав- нения экзонных областей кодирующего гена и разных вариантов его копий. Для O. semitorques выявлено два варианта псевдогена, для B. (N.) scandiacus – три, а для B. bubo – восемь. Для псев- догенов OCA2 обнаружен высокий уровень внутригеномного полиморфизма, обусловленный многими единичными мутациями, вставками и делециями разной длины. Для некоторых пар видов, спорно относимых к одному роду, выявлена глубокая дифференциация, соответствующая межродовому уровню генетических дистанций для гена OCA2 в других отрядах, что добавляет аргументов в пользу их родовой самостоятельности: O. sunia – O. semitorques (0.031), B. bubo – B. (K.) blakistoni (0.024) и B. (K.) blakistoni – B. (N.) scandiacus (0.022). Реконструкция филогенетиче- ских отношений совообразных и других исследованных таксонов по гену OCA2 в целом согласуется с построениями по другим молекулярным маркерам.

DOI 10.31857/S0016675825080051