Информация о гранте

Грант по программе Дальний Восток

Популяционно-генетическое разнообразие, филогеография и филогения хозяйственно-важных видов растений северо-восточной Азии

Номер: 18-4-011
Период выполнения: 2018 - 2019
Результаты:
2019
Изучено генетическое разнообразие и филогенетические связи Oxytropis evenorum из северо-восточной Азии по данным полиморфизма межгенных спейсеров psbA–trnH, trnL–trnF и trnS–trnG хлоропластной ДНК (хпДНК). Анализ молекулярной дисперсии показал, что около 81% всей генетической изменчивости приходится на межпопуляционную компоненту (ΦST = 0.80959; P < 0.0001). Реконструкция филогенетических связей близкородственных видов согласуется с представлением о гибридогенном происхождении O. evenorum с участием O. ochotensis. С использованием маркеров хлоропластного генома уточнен таксономический ранг 4 видов Oxytropis (O. litoralis, O. erecta, O. ochotensis, O. ruthenica) и проведена реконструкция их филогенетических взаимоотношений. Сравнительный анализ нуклеотидного полиморфизма межгенных спейсеров psbA-trnH, trnL-trnF и trnS-trnG 66 растений из 5 природных популяций O. ruthenica показал, что вид характеризуется высоким уровнем гаплотипического и относительно низким уровнем нуклеотидного разнообразия (h = 0.860, π = 0.0037), а также высоким уровнем популяционной дифференциации (ΦST = 0.82967; P < 0.0001). Выявлено 18 гаплотипов, из которых только два были общими для двух популяций. Реконструкция филогенетических связей O. ruthenica с близкородственными видами показала отчетливое разделение на 4 филетические линии: O. ochotensis, O. litoralis и O. erecta, O. ruthenica с о. Русский, другие популяции O. ruthenica. Сиквенцы гаплотипов O. litoralis и O. erecta практически идентичны и отличаются лишь количеством повторов в моно- и динуклеотидных мотивах, что указывает на единство генофонда и, возможно, виды конспецифичны. Получены и секвенированы ПЦР-продукты трех регионов хпДНК (psbA–trnH, rpl32-trnL, trnS-trnfM) у 17 растений Kalopanax septemlobus из популяций Приморского края. Проведено секвенирование и выравнивание 85 нуклеотидных последовательностей. Для выяснения филогенетических взаимоотношений в роде Salix северо-восточной Азии на основе секвенирования десяти регионов (petG–trnP, petN–psbM, psaA–ycf3, psbM–trnD, rpoB–trnC, trnC–petN, trnD–trnT, trnS–psbZ, rbcL, matK) хпДНК и ITS региона рибосомного оперона ядерной ДНК дополнительно исследованы S. ovalifolia, S. phlebophylla, S. rotundifolia, с тем, чтобы охватить секционное разнообразие рода. Проведена верификация образцов кустарниковых берез (Betula), собранных для молекулярно-генетического анализа. Установлено тождество Betula yoshimurae Miyabe et Tatew., описанной с Сахалина с B. sesselis Kom., распространенной в Охотии и на Северном Сихотэ-Алине; второе название является приоритетным для вида. Проведены полевые работы в различных районах Дальнего Востока и собраны образцы для молекулярно-генетических исследований родов Salix, Oxytropis, Kalopanax, Eleutherococcus, Betula, Rhodiola и др.