Полимофизм аминокислот в позиции 222 рецепторсвязывающего сайта гемагглютинина вируса гриппа А (H1N1) pdm09 у пациентов с летальной вирусной пневмонией в 2012-2014 гг.

Краснослободцев К.Г., Львов Д.К., Альховский С.В., Бурцева Е.И., Федякина И.Т., Колобухина Л.В., Кириллова Е.С., Трушакова С.В., Оскерко Т.А., Щелканов М.Ю., Дерябин П.Г.

В журнале Вопросы вирусологии (Voprosy Virusologii)

Год: 2016 Том: 61 Номер: 4 Страницы: 166-171

Представлены данные исследования секционного материала от пациентов, погибших от пневмонии, ассоциированной с вирусом гриппа a (h1n1)pdm09, в 2012–2014 гг., на наличие мутантных (позиция 222 в рецепторсвязывающем сайте гемагглютинина (нА)) форм вируса. всего, по совокупным данным, полученным тремя различными методами (секвенирование, next-generation sequencing (ngs), изоляция вируса), мутантные варианты вируса выявлены у 17 (41%) из 41 пациента. Доля мутантных форм в составе вирусной популяции колебалась от 1 до 69,2%. наиболее часто встречалась смесь дикого (D222) и мутантного (D222g) варианта, доля которого варьировала от 3,3 до 69,2% вирусной популяции. Реже в смеси обнаруживалась мутация D222n (от 1,1 до 5,5%). У одного из пациентов состав вирусной популяции был крайне неоднороден. Так, если в образце левого легкого выявлен только дикий тип D222, в правом легком обнаружена смесь вариантов 222D/g/n (65,4/32,5/1,1%), в трахее – смесь 222D/ g/Y/a (61,8/35,6/1,2/1,4% соответственно). в бронхах данного пациента выявлена смесь 222D/g/n/a (64,3/33,7/1/1% соответственно). Полученные данные свидетельствуют о том, что процесс адаптации вируса в нижних отделах респираторного тракта сопряжен с появлением различных вариантов вируса с мутациями в рецепторсвязывающем сайте нА. Образование мутантных форм вируса в тканях нижнего отдела респираторного тракта, видимо, приводит в большинстве случаев к вирусной летальной пневмонии. Однако если они представляют минорную часть популяции, их не удается выявить методом конвекционного секвенирования, но они могут быть обнаружены с помощью метода ngs.

DOI 10.18821/0507-4088-2016-61-4-166-171

Полный текст