Федеральное агентство научных организаций
Дальневосточное отделение Российской академии наук
Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии
Skip Navigation LinksДомашняя > Подразделения > Научные подразделения > Лаборатория паразитологии > Сотрудники > Персональная страница

АТОПКИН Дмитрий Матвеевич
Старший научный сотрудник
Кандидат биологических наук

Область научных интересов
Молекулярная биология, общая генетика, популяционная и эволюционная генетика, биотехнология, молекулярная паразитология.

Публикации:
1 Atopkin Dmitry M., Besprozvannykh Vladimir V., Ha Duy Ngo, Nguyen Van Ha, Nguyen Van Tang, Aleksey V. Ermolenko & Alina Yu.Beloded 2016. Morphometric and molecular data of the two digenean species: Lasiotocus lizae Liu, 2002 (Monorchiidae) and Paucivitellosus vietnamensis sp. n. (Bivesiculidae) from mullets Tonkin Bay, Vietnam // Journal of Helminthology. - P. 1-10. PDF
2 Besprozvannykh V.V. , Atopkin D.M. , Ngo H.D. , Ermolenko A.V. , Ha N.V. , Tang N.V., Beloded A.Yu. 2016. Morphometric and molecular analyses of two digenean species from the mullet: Haplosplanchnus pachysomus (Eysenhardt, 1892) from Vietnam and Provitellotrema crenimugilis Pan, 1984 from the Russian southern Far East // Journal of Helminthology. - Vol. 90. P. 238-244. PDF
3 Besprozvannykh V.V., Atopkin D.M., Ermolenko A.V., Beloded A.Yu. 2016. Morphometric and molecular analyses for a new species Skrjabinolecithum pyriforme n. sp. (Digenea: Haploporidae) in mullet fish from the Primorsky Region, Russia // Journal of Helminthology. - P. 1-8. PDF
4 Besprozvannykh V.V., Atopkin D.M., Ngo H.D., Ermolenko A.V., Van Ha N., Van Tang N. and Beloded A.Y. 2016. Morphometric and molecular analyses of two digenean species in mugilid fish: Lecithaster mugilis Yamaguti, 1970 from Vietnam and L. sudzuhensis n. sp. from southern Russian Far East. // Journal of Helminthology. - P. 1-6. PDF
5 Sokolov S.G., Gordeev I.I., Atopkin D.M. 2016. Redescription of trematode Gonocerca muraenolepisi Paruchin et Ljadov, 1979 (Hemiuroidea: Derogenidae), a body cavity parasite of Antarctic fishes, with a discussion of its phylogenetic position // Invertebrate Zoology. - Т. 13. №. 2. С. 191-202. PDF
6 Атопкин Д.М., Белодед (Никитенко) А.Ю., Нго Х.Д. 2016. Систематическое положение трематод Aphanurus mugilis (Hemiuridae: Aphanurinae) в надсемействе Hemiuroidea: данные секвенирования рибосомных генов // Современные проблемы теоретической и морской паразитологии: сб научных статей. - Севастополь. Том 1. С. 145-146.  
7 Atopkin D.M., Beloded A. Yu., Ngo H.D. 2015. Molecular systematics and phylogeny of the trematodes of mugilid fishes in the Far Eastern Region: two examples for digenean intraspecific genetic differentiation // Modern Achievements in Population, Evolutionary, and Ecological Genetics: International Symposium, (Vladivostok, Vostok Marine Biological Station, September 1-10, 2015) : Program & Abstracts.. - Vladivostok. P. 15.  
8 Atopkin Dmitry M., Ganin Gennady N. 2015. Genetic differentiation of black and grey colored forms of the earthworm Drawida ghilarovi Gates, 1969 (Moniligastridae, Oligochaeta) on Russian Far East // European Journal of Soil Biology. - Vol. 67. P. 12-16. PDF
9 Besprozvannykh V.V, .Atopkin D.M, .Ermolenko A.V, Nikitenko A.Yu. 2015. Restoration of the genus Parasaccocoelium Zhukov, 1971 (Digenea: Haploporidae) and a description of two new species from mugilid fish in the Far East of Russia // Journal of Helminthology. - Vol. 89. N 5. P. 565-576. PDF
10 Besprozvannykh V.V., Atopkin D.M., Ermolenko A.V., Kharitonova A.V., Khamatova A.Yu. 2015. Life-cycle and genetic characterization of Astiotrema odhneri Bhalerao, 1936 sensu Cho & Seo 1977 from the Primorsky Region (Russian Far East) // Parasitology International. - Vol. 64. P. 533-539. PDF
11 Mordukhovich Vladimir , Atopkin Dmitry , Fadeeva Natalia , Yagodina Victoria , Zograf Julia 2015. Admirandus multicavusand Adoncholaimus ussuriensissp. n. (Nematoda: Enoplida: Oncholaimidae) from the Sea of Japan. // Nematology. - Vol. 17. N 10. P. 1229-1244.  
12 ShedkoM.B., Sokolov S. G., AtopkinD.M. 2015. THE FIRST RECORD OF DIMEROSACCUS ONCORHYNCHI (TREMATODA: OPECOELIDAE) IN FISHES FROM RIVERS OF PRIMORSKY TERRITORY, RUSSIA,WITH A DISCUSSION ON ITS TAXONOMIC POSITION USING MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR DATA // Паразитология (Parazitologiia ). - Т. 49. №. 3. С. 171-189. PDF
13 Атопкин Д.М., Белодед (Никитенко) А.Ю., Нго Х.Д., Ха Н.В. , Танг Н.В. [D.M. Atopkin, A.Yu. Beloded (Nikitenko), H.D. Ngo, N.V. Ha, N.V. Tang] 2015. Молекулярно-генетическая характеристика дальневосточной трематоды Skrjabinolecithum spasskii Belous, 1954, (Digenea, Haploporidae) - паразита кефалевых рыб [Molecular genetic characterization of the far eastern trematode Skrjabinolecithum spasskii Belous, 1954, (Digenea, Haploporidae), a parasite of mullets] // Молекулярная биология [Molecular Biology]. - Т. 49. №. 3. С. 422-429. PDF
14 Атопкин Д.М., Белодед А.Ю., Нго Х.Д. 2015. Сравнительная генетическая характеристика трематод кефалевых рыб Приморского края Дальнего Востока России и Вьетнама // Паразитологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке: материалы V Межрегиональной конференции. - Новосибирск. С. 7-8.  
15 Беспрозванных В.В , Атопкин Д.М., Нго Х.Д., Белодед А.Ю., Ермоленко А.В., Ха Н.В., Танг Н.В. [V.V. Besprozvannykh, D.M. Atopkin, H.D. Ngo, A.Yu. Beloded, A.V. Ermolenko, N.V. Ha, N.V. Tang] 2015. Трематода Skrjabinolecithum spasskii Belous, 1954 (Digenea: Haploporidae), паразит кефалей (Mugilidae) из залива Петра Великого Японского моря и из Вьетнамских вод Тонкинского залива: морфология и молекулярные данные [The trematode Skrjabinolecithum spasskii Belous, 1954 (Digenea: Haploporidae), a mullet parasite (Mugilidae) from Peter the Great Bay of the Sea of Japan and from vietnamese waters of the Gulf of Tonkin: morphology and molecular data] // Биология моря [Russian Journal of Marine Biology]. - Т. 41. №. 4. С. 256-263 [267-275]. PDF
16 Каменская Д.Н., Панькова М.В., Атопкин Д.М., Брыков В.А. [Kamenskaya D.N., Pankova M.V., Atopkin D.M., Brykov V.A.] 2015. Гены гормона роста у рыб: доказательства функциональности паралогичных генов у гольца Salvelinus levanidovi [Fish growth-hormone genes: Evidence of functionality of paralogous genes in Levanidov's charr Salvelinus levanidovi] // Молекулярная биология [Molecular Biology]. - Т. 49. №. 5. С. 770-776 [687-693]. PDF
17 Atopkin D.M., .Nikitenko A.Yu, Ngo H.D. 2014. Genetic diversity and phylogenetic relatioships of the far eastern trematode Skrjabinolecithum spasskii Belous, 1954 (Digenea: Haploporidae) - a parasite of mugilid fishes // Molecular Phylogenetics: Contributions to the 4th Moscow International Conference. - Moscow. P. 9.  
18 Atopkin D.M., Nikitenko A.Yu., Ngo H.D. 2014. Genetic characterization of trematodes Haplosplanchnus pachysomus (Eysenhardt, 1892) from Vietnam and Provitellotrema crenimugilis Pan, 1984 (Trematoda: Haplosplosplanchninae) from Russian Primorye Region // Molecular Phylogenetics: Contributions to the 4th Moscow International Conference. - Moscow. P. 7-8.  
19 Atopkin Dmitry M. , Shedko Marina B. 2014. Genetic characterization of far eastern species of the genus Crepidostomum (Trematoda: Allocreadiidae) by means of 28S ribosomal DNA sequences // Advances in Bioscience and Biotechnology. - Vol. 5. N 3. P. 209-215. PDF
20 Ганин Г.Н. , Анисимов А.П. , Рослик Г.В. , Атопкин Д.М. , Соколова Е.Н. [G.N. Ganin, A.P. Anisimov, G.V. Roslik, D.M. Atopkin, E.N. Sokolova] 2014. Дальневосточный эндемик Drawida ghilarovi (Moniligastridae: Oligochaeta): полиморфизм, особенности экологии и кариотип [The Russian Far East endemic (Drawida ghilarovi, Moniligastridae: Oligochaeta): polymorphism, ecology specifics and karyotype] // ЗООЛОГИЧЕСКИЙ ЖУРНАЛ (ZOOLOGICHESKY ZHURNAL) [Russian Journal of Zoology]. - Т. 93. №. 9. С. 1070-1079. PDF
21 Alasaad Samer , Rozhkovan Konstantin V. , Atopkin Dmitry M. , Sánchez Antonio , Garrido-García José, Romero Ismael , Soriguer Ramón C. and Chelomina Galina N. 2013. RAPD-PCR molecular analysis of the threatened Cabrera’s vole populations in the Iberian Peninsula // African Journal of Biotechnology. - Vol. 12. N 26. P. 4065-4073. PDF
22 Besprozvannykh V.V., Ermolenko A.V., Atopkin D.M. 2013. Trematodes of the family Haploporidae Nicoll, 1914 from mugilid fishes of Primorye region: ribosomal genes sequence of the genus Skrjbinolecithum Belous, 1954 // Modern achievements in population, evolutionary and ecological genetics (MAPEEG - 2013): International Symposium. - Vladivostok. P. 13-14.  
23 Беспрозванных В.В., Ермоленко А.В., Атопкин Д.М. 2013. Трематоды семейства Haploporidae Nicoll, 1914 кефалевых рыб Приморья: данные частичного секвенирования гена 28S рРНК видов рода Skrjabinolecithum Belous, 1954 // Молекулярно-генетические подходы в таксономии и экологии: материалы Научной конференции. - Ростов-на-Дону. Том 1. С. 15.  
24 Вороной Н.О., Никитенко А.Ю., Атопкин Д.М. 2013. Приморские эстуарные поселения двустворчатого моллюска Corbicula japonica Prime, 1864 обладают низкой изменчивостью гена цитохромоксидазы (I) // Вестник Оренбургского Гос. университета. - Т. 158. №. 9. С. 85-90. PDF
25 Панькова М.В., Брыков В.А., Панькова В.В., Атопкин Д.М. [Pankova M.V., Brykov V.V., Pankova V.V., Atopkin D.M.] 2013. Гены гормона роста рыб. Дивергенция последовательностей интронов у гольцов рода Salvelinus [Fish growth hormone genes: Divergence of intron sequence in charrs of Salvelinus genus] // Генетика [Russian Journal of Genetics]. - Т. 49. №. 6. С. 743-750 [645-651].  
26 Atopkin D.M., Shedko M.B., Sokolov S.G., Zhokhov A.E. 2012. Comparative phylogenetic analysis of European and Far Eastern species of the genus Aspidogaster (Trematoda: Aspidogastrea) using sequences of ITS2 rDNA fragment // Molecular Phylogenetics: contributions to the 3-d Moscow International Conference. - Москва. P. 115.  
27 Besprozvannykh V.V., Ermolenko A.V., Atopkin D.M. 2012. The life cycle of Asymphylodora perccotti sp. n. (Trematoda: Lissorchiidae) in the Russian Southern Far East. // Parasitology International. - Vol. 61. N 2. P. 235-241. PDF
28 Voronoy N.O., Nikitenko A.Yu., Atopkin D.M. 2012. Comparative population genetic analysis of Corbicula japonica from Russian Primorye region using mitochondrial COI gene partial sequences // Molecular Phylogenetics: contributions to the 3-d Moscow International Conference. - Москва. P. 133.  
29 Атопкин Д.М., Шедько М.Б., Соколов С.Г., Жохов А.Е. 2012. Сравнительный филогенетический анализ европейских и дальневосточных видов рода Aspidogaster (Trematoda: Aspidogastrea) по данным секвенирования участка ITS1-5.8S-ITS2 рибосомальной ДНК // Современные проблемы общей паразитологии: материалы Международной научной конференции. - Москва. С. 31-35.  
30 Семенченко А.А., Атопкин Д.М. 2012. Сравнительный анализ дальневосточных видов хариусов Thymallus tugarinae и Thymallus grubii по данным секвенирования гена цитохрома b митохондриальной ДНК // Известия ТИНРО. - Т. 168. С. 59-69. PDF
31 Семенченко А.А., Атопкин Д.М. [Semenchenko A.A., Atopkin D.M.] 2012. Сравнительный анализ дальневосточных видов хариусов Thymalus tugarinae и Thymallus grubii по данным секвенирвоания гена цитохрома b митохондриальной ДНК [A comparative analysis of the Far-Eastern grayling species Thymalus tugarinae and Thymallus grubii flavomaculatus on the data from mitochondrial DNA cytochrome b gene sequencing] // Биология моря [Russian Journal of Marine Biology]. - Т. 38. №. 7. С. 520-528. PDF
32 Atopkin D.M. 2011. Genetic characterization of the Psilotrema (Digenea: Psilostomatidae) genus by partial 28S ribosomal DNA sequences // Parasitology International. - Vol. 60. P. 541-543. PDF
33 Atopkin Dmitry M., Shedko Marina B. 2011. GENETIC CHARACTERIZATION OF FAR-EASTERN SPECIES OF THE GENUS CREPIDOSTOMUM (DIGENEA: ALLOCREADIIDAE) BY RIBOSOMAL DNA SEQUENCES // Modern achievements in population, evolutionary and ecological genetics (MAPEEG - 2011):International Symposium. - Владивосток. P. 11.  
34 Sakka H., Quere J.P., Kartavtseva I.V., Pavlenko M.V., Chelomina G.N., Atopkin D.M., Bogdanov A.S. and Michaux J. 2010. Comparative phylogeography of four Apodemus species (Mammalia: Rodentia) in the Asian Far East: evidence of Quaternary climatic changes in their genetic structure // Biological Journal of the Linnean Society. - Vol. 100. P. 797-821.  
35 Атопкин Д.М., Шедько М.Б. 2010. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВЯЗИ ТРЕМАТОД РОДА CREPIDOSTOMUM (TREMATODA: ALLOCREADIIDAE) ЮГА ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ // Паразиты Голарктики: Международный симпозиум (4-8 октября 2010 г., Петрозаводск, Карелия, Россия). - Петрозаводск. Том 1. С. 20-23.  
36 Челомина Г.Н., Атопкин Д.М. [Chelomina G.N., AtopkinD.M.] 2010. Молекулярно-генетические свидетельства глубокого филогенетического разрыва между европейской и азиатской расами малой лесной мыши по данным изменчивости гена цитохрома b мтДНК [Molecular-genetic evidence of a deep phylogenetic discontinuity between the Asian and European reces of Pygmy wood mouse based on the mitochondrial cytochrome b gene variation] // Молекулярная биология [Molecular Biology]. - Т. 44. №. 5. С. 792-803 [699-708]. PDF
37 Atopkin D.M. 2009. Phylogenetic relationships of the genus Psilotrema (P. oschmarini, P. acutirostris, P. simillimum) based on 28S rDNA sequences // Modern achievements in population, evolutionary and ecological genetics (MAPEEG - 2009):Program and Abstract of International Symposium. - Владивосток. P. 13.  
38 Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В. 2009. Филогенетические связи рода Psilotrema (Digenea: Psilostomatidae) по данным секвенирования 28S рДНК // V съезда ВОГиС, Москва, 21-28 июня 2009. - Москва. Часть 2. С. 146.  
39 Богданов А.С.,Атопкин Д.М. , Челомина Г.Н. 2009. Анализ генетической изменчивости и дифференциации малой лесной мыши Sylvaemus uralensis (Rodentia, Muridae) методом RAPD-PCR // Известия РАН. Серия биологическая [Biology Bulletin]. - №. 3. С. 276-292. PDF
40 Atopkin D.M., Chelomina G.N. and Bogdanov A.S. 2007. Molecular phylogeography of two widespread rodent species Sylvaemus uralensis and Apodemus agrarius based on cytochrome b gene variation // Modern achievements in population, evolutionary and ecological genetics (MAPEEG – 2007). - Vladivostok. P. 8.  
41 Атопкин Д.М., А.С.Богданов, Г.Н. Челомина 2007. Генетическая изменчивость и дифференциация полевой мыши Apodemus agrarius: результаты RAPD-PCR анализа [Genetic variation and differentiation in striped field mouse Apodemus agrarius inferred from RAPD-PCR analysis] // Генетика [Russian Journal of Genetics]. - Т. 43. №. 6. С. 804-817.  
42 Атопкин Д.М., Челомина Г.Н., Богданов А.С. 2007. Микроэволюционные процессы в популяциях малой лесной (Sylvaemus uralensis) и полевой (Apodemus agrarius) мышей: данные секвенирования гена цитохрома b мтДНК // Современные проблемы биологической эволюции: материалы конференции. К 100-летию Государственного Дарвиновского музея.. - Москва. С. 159-161.  
43 Атопкин Д.М., Челомина Г.Н., Богданов А.С. 2007. Молекулярная филогенетика и филогеография лесных мышей рода Sylvaemus по данным частичного секвенирования гена цитохрома b митохондриальной ДНК // Териофауна России и сопредельных территорий. - Москва. С. 26.  
44 Челомина Г.Н., Атопкин Д.М., Богданов А.С. [Chelomina G.N., Atopkin D.M., Bogdanov A.S. ] 2007. Филогенетические связи видов и внутривидовых форм лесных мышей рода Sylvaemus по данным частичного секвенирования гена цитохрома b митохондриальной ДНК [Phylogenetic relationships between species and intraspecific forms of forest mice from the genus Sylvaemus as determined by partial sequencing of the cytochrome b gene of mitochondrial DNA ] // Доклады Академии Наук. - Т. 416. №. 2. С. 282-285 [356-359].  
45 Атопкин Д.М., Челомина Г.Н., Богданов А.С. 2005. Генетическая изменчивость полевой мыши Apodemus agrarius (Pallas, 1771) на территории бывшего СССР: данные RAPD-PCR анализа // Молекулярная и прикладная генетика: Международная научная конференция "Современные проблемы генетики". - Минск. Том 1. С. 69.  
46 Атопкин Д.М., Челомина Г.Н., Богданов А.С. 2005. Генетическое разнообразие и филогенетические связи трех хромосомных форм малой лесной мыши Sylvaemus uralensis Pallas, 1811 (Rodentia, Muridae): данные RAPD-PCR анализа // Эволюция жизни на Земле. - Томск. С. 49-51.  

Яндекс.Метрика