Год начала: 2009
Год окончания: 2009
2009
В порядке разработки мтДНК-филогении Salmonidae секвенированы три участка митохондриального генома (cytb, COI и D-петля) у 12 видов лососевых и хариусовых рыб (Thymallus - 1, Brachymystax - 2, Hucho -1, Parahucho - 1, Salvelinus - 5 видов) и одного отдаленного, но родственного им таксона – Umbra (Esociformes). Полученные данные вместе с материалами из GENBANK были сведены в единую матрицу, анализ которой различными методами позволил построить обоснованную схему матрилинейной филогении для 44 таксонов, представляющих практически все основные линии лососевых, хариусовых и сиговых рыб. Эта схема в своих принципиальных деталях оказалась полностью тождественна той, которая была получена нами в течение первого года работ по проектам на основе анализа ядерного гена RAG1.
В части разработки филогении Salmonidae на основе анализа последовательностей ядерного генома в 2010 г. были секвенированы фрагменты 10 ядерных генов у 23 видов лососевых, хариусовых и сиговых рыб, а также некоторых таксонов, взятых в качестве внешних групп. Предварительные результаты обработки этого представительного массива данных по ядерным генам оказались близки к тем, что были получены на основе анализа данных по митохондриальным геномам. Таким образом, созданы предпосылки для разработки схемы молекулярной филогении Salmonidae на основе одновременного анализа всех доступных типов данных - последовательностей как митохондриальной, так и ядерной ДНК.
