Информация о достижении

Успехи в анализе сложных систем позволяют надеяться, что системный подход в биологии превратится из эзотерического в основной и незаменимый инструмент биологии. Вопрос в том, как способствовать этой перемене. В программе CYTOSCAPE построена интерактома арабидопсиса, основанная на базе данных PAIR. Выделены основные регуляторные блоки, связывающие первичный и вторичный метаболизм . Эта работа проведена впервые в мире. Получилась хорошая предсказательная модель. После выхода статьи, некоторые предсказанные взаимодействия были подтверждены экспериментально в ряде публикаций в зарубежных журналах: подтверждено вовлечение в биосинтез антоцианов белка GL2, регулятора развития эпидермальных клеток; COP1/SPA модуля; компонентов, регулирующих суточные ритмы. Подтвердился наш прогноз об участии COI1 в биосинтезе вторичных метаболитов. Подтвердился прогноз относительно вовлечения в регуляцию биосинтеза вторичных метаболитов модуля EIN-ETR1 и TCP белков. Поскольку модель включает всю совокупность взаимодействующих белков, она будет использоваться для любых последующих предсказательных моделей. Например, для сельскохозяйственной биотехнологии (создание сортов, устойчивых к холоду и засухе). 

Публикации

Critical analysis of protein signaling networks involved in the regulation of plant secondary metabolism: focus on anthocyanins.

Bulgakov V.P., Avramenko T.V., Tsitsiashvili G.Sh.

В журнале Critical Reviews in Biotechnology

Год: 2016

DOI: 10.3109/07388551.2016.1141391